Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubl4bQ9CQ84 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ubl4bQ9CQ84 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubl4bQ9CQ84 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms