Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Use1Q9CQ56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Use1Q9CQ56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms