Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms