Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms