Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd3Q99PL7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms