Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn6Q99PL6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubxn6Q99PL6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms