Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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