Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms