Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rassf3Q99P51 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms