Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tsnaxip1Q99P25 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms