Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bco2Q99NF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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