Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms