Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms