Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gins4Q99LZ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms