Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms