Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Sh3bp5lQ99LH9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp5lQ99LH9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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