Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms