Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nmd3Q99L48 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms