Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok4Q99KE3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dok4Q99KE3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms