Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ddb2Q99J79 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms