Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan1Q99J59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan1Q99J59 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms