Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc33a1Q99J27 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc33a1Q99J27 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms