Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bbox1Q924Y0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms