Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clip1Q922J3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms