Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Supt16hQ920B9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Supt16hQ920B9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.9 ms