Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klc3Q91W40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klc3Q91W40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms