Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx9Q91VH2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms