Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp4Q8VHC5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp4Q8VHC5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms