Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf130Q8VEM1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf130Q8VEM1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.7 ms