Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fyco1Q8VDC1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms