Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmprss4Q8VCA5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmprss4Q8VCA5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms