Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc36Q8VBW8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms