Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnaaf4Q8R368 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnaaf4Q8R368 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms