Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms