Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hecw1Q8K4P8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms