Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Vrk3Q8K3G5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vrk3Q8K3G5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vrk3Q8K3G5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vrk3Q8K3G5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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