Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cnppd1Q8K158 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Cnppd1Q8K158 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnppd1Q8K158 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnppd1Q8K158 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnppd1Q8K158 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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