Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbrd1Q8K0B2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbrd1Q8K0B2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbrd1Q8K0B2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms