Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d5Q8JZW5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d5Q8JZW5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms