Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LgsnQ8CIX8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LgsnQ8CIX8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms