Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc9Q8CDN9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc9Q8CDN9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms