Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo43Q8CDI2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo43Q8CDI2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms