Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrebrfQ8CDG5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrebrfQ8CDG5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms