Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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