Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms