Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg4aQ8C9S8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Atg4aQ8C9S8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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