Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cwc22Q8C5N3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cwc22Q8C5N3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms