Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc90bQ8C3X2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms