Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms