Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pbrm1Q8BSQ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pbrm1Q8BSQ9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pbrm1Q8BSQ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms